傳統牙周病治療中,效果確切的治療方式是將牙根作深層清潔整平的步驟，牙根整平術對牙周病的感染控制, 有明確的效果。若能在此流程中有確實的治療, 通常可將牙周病手術的機率降至最低。
但是，大部分的患者在接受傳統治療之後, 通常會感到口腔情形有明顯改善, 例如: 口腔不再有異味, 刷牙時出血減少等等。
可是不在少數的患者會害怕治療過程中打麻藥前中後的不舒服感，以及牙結石在做刮除及牙根整平後的不舒適感感到害怕。因而，低疼痛雷射牙周治療開始便開始興起。
雷射治療應用在醫學上的研究，已經行之多年. 尤其在醫學美容上的應用，非常普遍。而雷射在牙周病治療的應用上，則因牙周病生成原因不同，所以使用的雷射也不同，大致可分為：二氧化碳雷射、釹雅克雷射、二極體雷射、鉺雅克雷射以及鉺鉻YSGG雷射，而雷射因能量的不同對牙周組織治療的作用亦不同。
在牙根深部清潔整平之相較，雷射與傳統牙周治療的不同處。
1.雷射可以有效減低治療時與治療後傷口的出血。
2.雷射移除牙結石的效率與雷射的能量成正相關，然而較高的能量對移除牙結石後造成牙根表面的粗操程度也最大，可能會違反牙周治療中牙根整平的治療原則。
3.雷射造成的微粗糙的牙根表面是否會破壞生物相容性，進而影響結締組織的附連，則有待實驗進一步證實。
直至目前為止，還沒有足夠的長期試驗證實雷射刮除牙結石其效果是優於傳統的牙結石刮除合併牙根整平，仍需要更多試驗來加以驗證。
美國牙周病學會認為，雷射尚不能完全取代傳統牙周手術。
呂醫師認為：
如果您的牙周病是屬於輕微的牙周病中硬組織的破壞，在確認牙根結石狀況下，患者可選擇不需施打麻藥直接進行低疼痛的雷射治療。
如果經醫師判斷屬於牙周軟組織發炎狀況嚴重者，經確認牙周病為中度以上，需施打麻藥才能確實將牙根之附著物清除, 且將牙根做適當整平, 則此時建議用雷射治療合併傳統牙周治療之深部清潔整平較佳。
如果重度牙周病治療單純只以雷射來做醫療處理，的確會有去除了發炎的假象，但是因此耽誤了病情與治療時機，會產生治標不治本的結果。
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